Hodnotenie programov financovaných z EŠIF je proces posudzovania intervencií podľa ich výsledkov, dopadov a miery, do akej spĺňajú potreby, ktoré majú za cieľ riešiť. Hodnotenie v EŠIF výkonáva centrálny koordinačný orgán a riadiace orgány v spolupráci s gestormi horizontálnych princípov v zmysle európskej legislatívy.
Hodnotenia sa zameriavajú na efektívnosť, účinnosť, relevantnosť intervencií ako aj ďalšie kritériá. Hodnotenia môžu zahŕňať aj hĺbkové analýzy alebo prípadové štúdie situácie na ďalšie pochopenie politiky v konkrétnej situácii a kontexte.
CKO každoročne vypracováva súhrnnú správu o aktivitách hodnotenia a výsledkoch realizovaných hodnotení fondov EÚ. Výsledky hodnotení spracováva do publikácií pre verejnosť a zároveň zverejňuje v Evaluačnej knižnici.
Oddelenie hodnotenia komunikuje s evaluačnými jednotkami Európskej Komisie a iných členských štátov EÚ, sprostredkováva prenos informácií na národnú úroveň a vykonáva školiacu, metodickú a podpornú činnosť pre riadiace orgány.
Informácie o činnostiach a aktivitách oddelenia hodnotenia sú zverejnené na webovom sídle http://www.partnerskadohoda.gov.sk/hodnotenie-esif/